1. Contexte scientifique

Dans le cadre du projet Bacnet, nous nous intéressons aux interactions entre les ARN non-codants et leurs cibles potentielles : les mRNA. La prédiction des interactions entre ARN est un problème complexe. Comme il n'existe pas de méthode faisant l'unanimité pour traiter ce problème, nous avons décidé de créer un pipeline intégrant différentes méthodes. Une interfrace sera ajoutée pour visualiser les prédictions et faciliter leur analyse.

2. Description de la demande

• développement d'un pipeline pour la prédiction d'interaction ARNnc-ARNm
• intégration de différents outils pour la prédiction de cibles :
• intaRNA
• RNAplex
• RNAcofold
• RIsearch
• ssearch36
• développement d'une interface Web pour la visualisation et l'exploration des résultats

3. Organisation

## 3.1 Planning Développement jusqu'à la fin du contrat

3.2 Personnes

Développement : Anaïs Tests Christine et Anaïs

3.3 Ressources matériels

Aucun besoin spécifiques ## 3.4 Ressources financières Sur ANR Bacnet

4. Échéancier

Mars 2014 jusqu'à fin contrat Bacnet

5. Critères de validations

Test sur les données fournies par l'Institut Pasteur dans le cadre du projet.